Pour qu’un arbre se pétrifie, il doit se trouver dans un environnement anaérobie pour échapper au pourrissement ; en d’autres termes, il doit être enfoui dans un environnement exempt d’oxygène, comme un méandre d’une rivière riche en vase limoneuse, le fond d’un lac, et c’est sans doute le cas le plus fréquent, dans des dépôts volcaniques.